黔南民族师范学院学报

2019, v.39;No.209(04) 26-31

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马铃薯60S核糖体蛋白L28-1基因的生物信息学分析
Bioinformatic Analysis of 60S Ribosomal Protein L28-1 Gene in Potato

卫红萍;马笑笑;

摘要(Abstract):

以马铃薯与青枯菌互作过程中产生的一条EST为实验材料,初步推定该EST表达蛋白可能参与马铃薯青枯病的抗性。通过对这条上调表达的EST核酸构成、氨基酸的构成和该EST编码的可能蛋白质的高级结构进行初步的推理剖析、序列分析,结果表明:该EST的长度为601bp,其中部有429个碱基编码了含143个氨基酸的肽段,该小肽一端是明显的亲水的,一端为显著的疏水的,无信号肽,无二硫键,无膜穿透性,二级结构中含有的无规则卷曲比较多,有多个磷酸化位点,含保守结构域,经分析,与野生种潘那利番茄RPL28-1相似度最高,默示与野生种潘那利番茄RPL28-1拥有大致差不多的构造,发挥出差不多作用。因此以上结果可以为进一步研究该基因编码蛋白的具体功能和在青枯菌与马铃薯互作过程中发挥作用。

关键词(KeyWords): 马铃薯;60S核糖体蛋白类L28-1;生物信息学

Abstract:

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基金项目(Foundation):

作者(Author): 卫红萍;马笑笑;

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